Маленькая любопытная рыбка Поньо — дочь колдуна и прекрасной морской богини — уплывает из дома, чтобы понаблюдать за жизнью людей.
Поньо застревает в банке и оказывается выброшенной на берег.
Её подбирает пятилетний Сосукэ.
Малыши привязываются друг к другу, и теперь у Поньо только одно желание — стать человеком.